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本课程以微生物培养与显微检验相关专业岗位需求和国家、行业、企业标准规范为基础，以菌种制备和菌种显微检验为项目载体，以工作任务为驱动，以工作过程“理实一体”为重点设计和组织课程内容。本课程内容的设计起始于课程岗位说明，在岗位认知的基础上设计了菌种制备和菌种显微检验两个项目，同时针对工作岗位中常见的菌种类型，在每个项目下设计了细菌、酵母菌、放线菌、霉菌菌种制备和显微检验子项目。工作任务包括制备培养基、灭菌、菌种转接、培养、保藏和菌种制片、显微观察。
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