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环境工程微生物学是环境工程、环境科学等专业必修的一门专业核心课程。主要介绍环境工程中的污（废）水生物处理和水体、土壤及大气污染与自净过程中牵涉的、学生必须掌握的微生物学知识，以及饮用水细菌学及其检验。内容包括细菌、放线菌、酵母菌、霉菌、原生动物、微型后生动物及藻类等的形态、大小、细胞结构与功能；微生物的生理、微生物与环境因素的关系，微生物的生长繁殖、遗传变异；以及微生物生态等。通过本课程的学习，使学生系统地掌握微生物学基础理论，掌握微生物在环境中所处的地位、与环境的关系以及在物质转化过程中所起的作用，能利用微生物学知识解决环境领域相关问题。
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