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有机化学Ⅱ课程涵盖醛和酮、羧酸及羧酸衍生物、脂肪胺、含氮芳香化合物、杂环化合物和生物大分子的性质、结构和制备，重要有机反应的历程、影响因素及其在合成上的应用。课程团队综合十余套国内外经典教材，在课程编排上以化合物为顺序、以反应为线索，借助慕课的形式将知识点精准覆盖，内容具有高阶性和挑战度；章节介绍字斟句酌，提炼了每一节的重点内容和学习要求，创新性的练习和测验充分考查学生对知识的综合理解和运用；抓住结构和性质的关系这一主线，注重知识的联系，结合丰富的实例和精美的图示，与学生共同勾勒出有机化学的全景和脉络。
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